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2结果与讨论 2.1衣藻叶绿体基因组中ORF框的鉴定与统计 从GenBank数据库下载衣藻叶绿体基因组序列，序列总长度为203828bp。结合已知注释和开放通读框预测的
2结果与讨论
2.1衣藻叶绿体基因组中ORF框的鉴定与统计
从GenBank数据库下载衣藻叶绿体基因组序列，序列总长度为203828bp。结合已知注释和开放通读框预测的结果，我们最终在衣藻叶绿体基因组中鉴定出70个蛋白编码基因(表1)，当然这些基因并没有进行长度筛选，有些蛋白不超过100个氨基酸。为了减少长度对密码子用法评估带来的样本误差，通常要挑选出了以ATG为起始密码子、以TAG、TAA或TGA为终止密码子并且编码区的序列长度不小于300bp的蛋白质编码基因进行抽样，这样后续分析才能准备评估密码子用法偏好性。经过筛选，最终得到了符合条件的59个蛋白编码基因当做本次研究的序列样本。