2.4 油菜油体固醇蛋白基因的序列分析 为了阐明油菜油体固醇蛋白基因的结构特征,本研究利用GSDS软件[13]对这些基因的基因组DNA序列与编码框CDS序列进行
2.4 油菜油体固醇蛋白基因的序列分析
为了阐明油菜油体固醇蛋白基因的结构特征,本研究利用GSDS软件[13]对这些基因的基因组DNA序列与编码框CDS序列进行比较,鉴定出内含子和外显子的剪接位点,从而鉴定出这些基因的结构和内含子相位的规律。此外,为探明油菜油体固醇蛋白的功能结构域,笔者还利用Pfam[14]在线工具对这些蛋白的结构域进行扫描,同时还利用MEME工具[15]对这些蛋白包含的保守模体进行鉴定,进而对这些蛋白保守模体和功能结构域进行比较分析。最后,作者利用TMHMM工具[16]对这些油体固醇蛋白进行跨膜结构域预测,看是否这些蛋白被包埋在油体单层磷脂膜中。