1.2蛋白质晶体结构分析预测领域的研究现状与发展

第二章蛋白质复合物界面丙氨酸残基突变计算研究

2.1蛋白质的组成

从我们以前学的知识可以知道氨基酸是蛋白质的基本组成部分，现阶段被人类认知的氨基酸种类有20种，所有的蛋白质皆是由这20种氨基酸形成的生物大分子。氨基酸之间脱水形成的化学键称为肽键，多个氨基酸按照一定顺序通过非共价作用力下链接形成肽键结合而成的特定结构就是蛋白质，这种顺序与基因中遗传信息有着直接联系。肽链是由氨基酸通过肽键链接形成的，其化学反应如图

2-1所示。蛋白质的主链和骨架是由多肽链构成的，而残基就是肽链中的氨基酸，每个蛋白质都是由一条或多条不同类型的侧链组成。蛋白质种类有很多，分类方式也有很多：从分子形状上来区别，可分为球蛋白和纤维蛋白；按化学成分组成来看，可分为简单蛋白和结合蛋白[16]。

2.2蛋白质的相互作用

蛋白质相互作用被科学家分为两大类。第一类是因为物理相互作用，其本质蛋白质之间存在相互吸引的作用力或着在结构上互补从而使两个或多个蛋白质物理上相互结合在一起，形成蛋白质复合物。第二类是因为遗传相互作用，基于遗传学某个基因的突变导致另一个基因表达行为改变，这种相互作用的表现是由蛋白质功能间的联系实现的，所以并没有物理上的接触[17]。